Наиболее частыми обитателями аквариума являются брюхоногие моллюски (улитки) с цельной закрученной раковиной. Их присутствие желательно во всех аквариумах, за исключением нерестовых. Они приносят пользу тем, что поедают остатки корма, экскременты, водоросли, способствуя тем самым биологическому равновесию в аквариуме.
Полезны в аквариумах и двустворчатые моллюски, которые дышат жабрами и, в отличие от улиток, малоподвижны. Они выполняют роль живых биологических фильтров, поглощая вместе с водой муть и мельчайшие организмы. Для таких видов рыб, как горчаки, двустворчатые моллюски просто необходимы — в мантийную полость этих моллюсков они откладывают икру. Однако следует учитывать, что большинство двустворчатых моллюсков из отечественных водоемов не могут жить в воде, температура которой превышает 20 °С.
Моллюсков из природных водоемов нельзя помещать в аквариум без длительного карантина. Необходимость карантина обусловливается тем обстоятельством, что многие из них являются промежуточными хозяевами опасных для рыб, а иногда и для человека (малый прудовик), паразитов.
Голодных улиток немногие виды корма привлекают также, как свежая икра, поэтому нельзя помещать улиток в нерестовые аквариумы, поскольку они или пожирают, или повреждают икру рыб, обволакивая ее слизью.
Однако в аквариум с достаточно подросшими мальками улиток помещать не только можно, но и полезно. Иногда аквариумисту трудно определить, сколько корма нужно растущим малькам. Недокорм мальков приводит к сильному отставанию в росте. Избыток же корма приводит к его загниванию и гибели большей части мальков. Наличие улиток, которые успешно справляются с излишками корма, сводит опасность перекармливания рыб к минимуму.
Опасность в аквариуме могут представлять и размножающиеся двустворчатые моллюски, так как их личинки паразитируют на рыбах.
В аквариумах содержат и некоторых нехищных водных жуков. Так, к примеру, водолюбов, которые питаются в основном растительной пищей, содержат для борьбы с обрастанием.
В аквариумах живет и особая группа животных — мшанки. Обычно они попадают в аквариум случайно,
вместе с кормом. В аквариумах, за исключением нерестовых, они практически безвредны. Более того, их присутствие свидетельствует о нормальном биологическом равновесии.