Насчитывается около 1500 видов паразитов рыб.

Заразными болезнями являются:

* Инвазионные (паразитарные) болезни, которые вызываются паразитами животного происхождения: протозоозы (вызываются жгутиконосцами, споровиками, инфузориями), гельминтозы (вызываются паразитическими червями), крустацеозы (вызывабтся паразитическими ракообразными).
* Инфекционные болезни, которые вызываются возбудителями растительного происхождения: бактериями, вирусами, паразитическими грибками.

Часто возбудители заразных заболеваний попадают в аквариум вместе с кормом, который был добыт в водоёме, где водится рыба. Переносчиками червей, инфузорий, грибов и других патогенных простейших организмов являются многие виды планктонных и бентосных животных, используемых в качестве корма. Так, промежуточными хозяевами червей-сосальщиков Dactylogurus vastafor, Girodactilus elegans, простейших паразитов могут быть циклоп и коловратка. С плохо обработанным мотылём и трубочником в аквариум попадают находящиеся в стадии покоя Ichthyophthirius multifilliis, Costia necatrix, Chilodonella cyprini и некоторые другие возбудители болезней.

Многие из возбудителей заразных заболеваний поражают определённые виды рыб. Так, инфузория поражает только пресноводных рыб, Ichthyosporidium (Ichthyophonus) hoferi поражает органы и ткани морских и пресноводных рыб.