Грибки относятся к особому царству живых организмов, сочетающих в себе признаки как растений, так и животных, и имеют более высокую организацию, чем бактерии. Грибки, обитающие в воде, могут жить как сапрофиты, факультативные сапрофиты, факультативные паразиты и чистые паразиты.

Среди патогенных для рыб грибков можно выделить три различных инфекционных вида:
1. Внешние микозы
2. Бранхиомикозы
3. Внутренние микозы

Грибковые заболевания (микозы) поражают исключительно поверхность тела рыб в местах ран, язв или вследствие бактериальной инфекции. Их легко заметить по налету из белых грибных нитей, похожих на кусочки ваты. Это дерматомикоз, или внешний микоз. Внешние микозы могут вызываться различными грибками семейств Saprolegniaceae и Peronosporaceae.

Бранхиомикоз — грибковое заболевание жабр, которое также называется жаберной гнилью (не следует путать с бактериальной жаберной гнилью). Это заболевание вызывается грибками рода Branchiomyces. И, наконец, существуют внутренние микозы, при которых поражаются внутренние органы. Эти грибки различимы только при тщательном исследовании под микроскопом.